Ваш вопрос: Как играть с компаньоном Вилья, чтобы сейв не разрастался?

Ответ:

Не давать Вилье щит, и временами отпускать Вилью – сейв со временем приходит в норму.

Если же у вас забаговалось совсем, то попробуйте очистить ваше сохранение изучив гайд по очистке: https://lastrium.com/index.php?/wiki/guides